我可以用酒精做微生物樣品的保護劑嗎？

時間：2014-12-19

	作者：Michelle Tetreault Carlson  來源：美國MoBio實驗室【字號：大 中 小】


	
		歡迎回來！我們將繼續(xù)回來與大家一起分享一些新穎的不一樣的想法。分享一些客戶常問的技術問題，以及我們的回答?？茖W家們提出了使用我們產(chǎn)品過程中遇到的問題，我們給與了回答，還有什么比這個較節(jié)省您的時間？
	
	
		這周我們我們討論：為什么用酒精作為防腐劑保存環(huán)境樣品不是個好主意？
	

	
		問：我們想用PowerSoil DNA Isolation Kit提取從物體表面采集的棉拭子DNA。
	
 
	
		對方法上是否有比較好的建議？通常我們會先潤濕滅菌面前，擦拭物體表面，然后把面前浸入到溶液中（可能是70%）。經(jīng)過適當浸泡后，轉(zhuǎn)移一些溶液到PowerBead Tubes中，然后按照說明書進行提取。使用酒精會影響提取結果嗎？
	
	
		有沒有從物體表面（如門把等）上采集樣品建議操作方法嗎？
	
	
		非常感謝！
	
  
	
		雖然酒精能成功地保護龍舌蘭蟲的DNA，但對細菌并不合用。為什么呢？因為酒精常用于進行分子鑒定前對實驗操作臺進行消毒處理。我們用酒精滅菌。如果用酒精保存用于微生物組分析的棉拭子、土壤等其它樣品，你會獲得擦拭實驗操作臺同樣結果。酒精會殺死幾乎所有微生物。當細胞壁消失后，DNA會被釋放到上清液中，從可溶的雜質(zhì)中分離DNA將非常困難。
	
	
		我們曾經(jīng)嘗試分別從用**、70%和50%酒精保存的土樣中提取DNA，結果是失敗的。用酒精保存的水樣濾膜也同樣失敗。沒有任何**。
	
	
		對于棉拭子，較好的保存運輸條件是干燥。干燥的物體表面，只要刮取你要檢測的地方即可，不需要用到鹽水。而口腔棉拭子或濕的樣品，讓其在空氣中自然干燥，然后可在-20℃長期保存或運輸，室溫也可以。當拭子為干燥狀態(tài)，上面沾染到的細菌和真菌就停止生長。我們需要的不是消毒。
	
	
		因為DNA這種強壯的分子能在環(huán)境中保存相當長一段時間，所有我們通常建議土樣或水樣濾膜干燥、冷凍保存和運輸。土樣在不同溫度條件下長期保存過程中發(fā)生變化的相關數(shù)據(jù)正在收集當中。有了結果后我們會先大家公布。
	
	
		同時，我們建議準備使用RNA PowerSoil Kit提取RNA的土樣加入LifeGuard Soil Preservation Solution。加入LifeGuard后的土樣還應該盡快放入到冰箱，較好是-20℃，以獲得較原始的RNA當然剪影。這是因為RNA表達隨著環(huán)境的變化發(fā)生突然改變。當樣品放入到溶液中，微生物的生長繁殖就停止了。
	
	
		對基于DNA的微生物組學研究，因為基因組當然不會馬上發(fā)生改變，原始狀態(tài)保存土壤不加任何額外液體是較簡單、較少干擾和較省錢的辦法。
	
	
		讓你的微生物樣品遠離酒精吧。如果你要研究龍舌蘭蝴蝶幼蟲，它是一種很好的防腐劑。是有效放腐，不是消化。如果你想知道門把手或土壤中有哪些微生物，就讓它們保持在原始的生長基質(zhì)中，或干燥的濾紙或棉拭子。它們跟DNA一起保持靜止、完整。

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