百螢課堂之蛋白印跡法常見問題及解答

    無信號

    1、一抗和二抗不匹配:二抗需和一抗宿主的物種相同(一抗來自鼠,二抗便是抗鼠抗體)。

    2、沒有足夠的一抗或二抗結(jié)合目標(biāo)蛋白:使用高濃度抗體。4℃延長孵育時(shí)間。(如過夜)

    3、封閉劑與一抗或二抗有交叉反應(yīng):使用溫和的去污劑,如吐溫-20,或換封閉劑(常用脫脂奶粉、BSA、、明膠)。

    4、一抗不識別待檢物種的蛋白:參照說明書,對比原序列和蛋白序列以確保抗體和目的蛋白會(huì)發(fā)生反應(yīng)。設(shè)置陽性對照。

    5、蛋白上樣量不足:每條泳道蛋白上樣量不過20ug,使用蛋白酶抑制劑并設(shè)置陽性對照。

    6、組織中目的蛋白含量低:濃縮使信號大化。

    7、轉(zhuǎn)膜不充分:使用可逆染色劑轉(zhuǎn)膜效果,檢查轉(zhuǎn)膜操作是否正確。PVDF膜需預(yù)先浸在中,然后浸到轉(zhuǎn)移緩沖液中。

    8、洗膜過度:勿過度洗膜

    9、過度封閉使目標(biāo)蛋白不能顯色:使用0.5%奶粉或無奶粉代替5%奶粉的抗體稀釋液?;驌Q封閉膜,減少封閉時(shí)間。

    10、一抗失效:使用新鮮抗體,重復(fù)使用有效濃度會(huì)降低。

    11、二抗受疊氮鈉抑制:避免疊氮鈉和HRP標(biāo)記抗體一起使用。

    12、檢測試劑盒過期和底物失活:使用新鮮的底物。

    背景高

    1、未進(jìn)行特異性封閉或封閉不充分:延長封閉時(shí)間,考慮換合適的封閉劑。

    2、一抗?jié)舛冗^高:稀釋抗體至合適濃度,以高稀釋度抗體延長孵育時(shí)間(耗時(shí)長,但特異性結(jié)合好)。

    3、二抗與封閉劑非特異性結(jié)合或反應(yīng):設(shè)置二抗對照(不加一抗)。

    4、未結(jié)合蛋白質(zhì)洗滌不充分:增加洗滌次數(shù)。

    5、選膜不當(dāng)產(chǎn)生的高背景:纖維素膜比PVDF膜背景低

    6、膜干燥:在孵育過程中防止膜變干,每一步都要保證膜有充分的反應(yīng)液,可放入攪拌子不斷攪動(dòng)或輕輕震蕩使膜浸在溶液中。

    多帶現(xiàn)象

    1、細(xì)胞傳代次數(shù)過多,蛋白表達(dá)不同:使用原始未傳代的細(xì)胞株,和現(xiàn)在的細(xì)胞株一起做平行對照實(shí)驗(yàn)。

    2、體內(nèi)表達(dá)的蛋白樣本具有多種修飾形式如乙?;⒓谆?、烷基化、磷酸化、糖基化等:參考文獻(xiàn),使用試劑使樣品去磷酸化、去糖基化來證明翻譯后的修飾。

    3、蛋白樣本降解(蛋白質(zhì)分子量降低):在樣品緩沖液中加入足夠的蛋白酶抑制劑。

    4、檢測到未經(jīng)報(bào)道過的新蛋白或同一蛋白家族中具有相似表位而結(jié)構(gòu)不同的蛋白:查閱其他文獻(xiàn)報(bào)道,或BLAST搜尋,使用說明書的細(xì)胞株或組織。

    5、一抗?jié)舛冗^高,高濃度時(shí)常出現(xiàn)多條蛋:降低蛋和/或孵育時(shí)間。

    6、二抗?jié)舛冗^高,高濃度產(chǎn)生非特異性結(jié)合:降低抗體濃度,加入二抗對照(不加一抗)。

    7、抗體未經(jīng)純化:使用親和純化的抗體,減少非特異條帶。

    8、目標(biāo)蛋白形成多聚體:SDS-PAGE電泳加樣前,煮沸10 min而不是5 min,使蛋白質(zhì)解聚。

    背景有不均勻的白色斑點(diǎn)

    轉(zhuǎn)膜時(shí)膜上有氣泡或抗體在膜布不均:轉(zhuǎn)膜過程中盡量去除氣泡,抗體孵育時(shí)保持搖動(dòng)。

    背景有黑色斑點(diǎn)

    抗體結(jié)合了封閉劑:過濾封閉劑

    深背景出現(xiàn)白色條帶

    一抗或二抗加入過多:稀釋抗體的濃度

    目的條帶染色過低/過高

    分離不

    改變凝膠比例:分子量大的蛋白用低濃度膠,分子量小的蛋白用高濃度膠。

    條帶“微笑”效應(yīng)

    遷移過快

    電泳溫度過高(改變了PH值和遷移速度)。降低遷移速度或低溫電泳。(冷庫或冰上)。

    相同蛋白雜交出現(xiàn)了不均勻條帶

    制備凝膠時(shí),凝膠凝固太快,致使泳道中的比例不均勻。

    參照凝膠的配方,在凝膠中加入適量TEMED,放置時(shí)在凝膠部加入適量1%SDS(水稀釋)以防凝膠變干。

    凝膠染色不均勻

    細(xì)菌污染:4℃保存抗體并使用新鮮的緩沖液浸泡膠體。

    抗體量不足:確保振蕩條件下孵育膜或抗體充分覆蓋膜。


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