Tris緩沖液是蛋白質(zhì)電泳和蛋白質(zhì)印跡的組成部分。大多數(shù)SDS-PAGE凝膠、電泳緩沖液和印跡緩沖液都用Tris緩沖。
Tris緩沖液在蛋白質(zhì)電泳中的應用
大多數(shù)SDS凝膠使用不連續(xù)的Tris緩沖系統(tǒng)。濃縮凝膠具有大孔,因此較大的肽可以輕松遷移通過,通常在pH6.7–6.8下配制。在此pH值下,離子化的氯離子會迅速遷移,從而提高它們后面的pH值并產(chǎn)生一個具有低電導率區(qū)域的電壓梯度,這會導致甘氨酸(來自運行緩沖液)電離并遷移到氯離子*后面。樣品中的大多數(shù)肽由于結(jié)合了SDS而帶負電荷,在氯化物和甘氨酸之間遷移,形成窄帶,從而“堆積”。一旦堆棧到達分離凝膠,其處于較高的pH值(通常為pH值8.7-8.8),甘氨酸的電離增加會使其加速并**過肽段。此外,較小孔徑的分離膠開始產(chǎn)生篩分效果,導致肽段按大小分離。
大多數(shù)蛋白質(zhì)印跡實驗方案使用低離子強度的Tris緩沖液進行蛋白質(zhì)轉(zhuǎn)移。轉(zhuǎn)移時間取決于印跡裝置的類型和感興趣的肽大小范圍。
Tris緩沖液在核酸瓊脂糖電泳中的應用
Tris緩沖液廣泛用于DNA瓊脂糖電泳。兩種主要緩沖液是TBE(Tris鹽/EDTA)和TAE(Tris鹽/EDTA)。盡管不同形式的DNA的分辨率及其在電泳過程中的遷移率存在一些差異,但這些Tris緩沖液通??梢曰Q使用。TBE中的鹽離子會抑制許多酶,因此如果在電泳后不進行某種類型的DNA純化,一些酶介導的下游操作可能不起作用。因此,在大多數(shù)DNA實驗室中,TAE緩沖液在日常使用中受到青睞。
制作Tris緩沖液
Tris緩沖液是大多數(shù)生物系統(tǒng)的不錯選擇,因為它在25°C時的pKa值約為8.1,使其成為pH7-9范圍內(nèi)的有效緩沖液。該pH值范圍適用于大多數(shù)生物過程。Tris粉末也比較專業(yè)的緩沖液(如HEPES)較便宜且較耐用。
有兩種方法可以制備Tris緩沖溶液。一種是制備所需濃度的Tris堿和Tris-HCl溶液,然后將一種溶液(通常為Tris-HCl)的等分試樣添加到另一種(通常為Tris堿)溶液中,同時監(jiān)測pH值直至獲得正確的pH值。在實踐中,很少這樣做。
制作大多數(shù)常用Tris緩沖液的常用方法是僅從Tris堿基開始。將適量的Tris粉末溶于水中,用HCl調(diào)節(jié)pH值,然后將緩沖液配制成所需體積。假設(shè)在調(diào)節(jié)pH值時沒有過沖,該方法不會改變離子強度。但是,在過沖并用NaOH重新調(diào)整后,或使用Tris-HCl并用NaOH調(diào)整pH值后,離子強度會發(fā)生變化。根據(jù)Tris緩沖區(qū)的預期用途,此類更改可能重要也可能不重要。
制作Tris緩沖液時,在調(diào)節(jié)pH值時使用與Tris兼容的電極很重要。當與Tris緩沖液一起使用時,單結(jié)Ag/AgCl電極會表現(xiàn)出不穩(wěn)定性,因為銀會逐漸沉淀并堵塞電極。使用雙結(jié)或甘汞參比電極可確保在Tris緩沖液中進行準確的pH測量。
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