ChromasPro適用于DNA序列組裝項目,可達到幾兆字節(jié),并進行基本序列編輯和分析。它能夠從Sanger序列器,比如ABI,454和Illumina下一代序列器中組裝數(shù)據(jù),如果有8GB的可用內(nèi)存,則較多可組裝1,000,000個序列。
ChromasPro具體功能:
打開Applied Biosystems .ab1, Staden Chromatogram (SCF and ZTR), 454 SFF, FASTA, FASTQ, EMBL, GenBank, SwissProt, GenPept, GCG RSF和純文本格式中的序列。
以.ab1, .scf, .fasta 和.fastq格式保存序列。
使用圖形界面組裝重疊序列,生成一致性并**模糊性進行編輯。
使用高質(zhì)量數(shù)據(jù)自動去除低質(zhì)量序列以改進序列組裝。
使用參考序列作為組裝的支架。
生成限制位點和片段圖,并列出切割,非切割和片段。
映射開放閱讀框,由G+C框架圖輔助,并用一次點擊翻譯ORFs。
打印色譜圖,限制位點和片段圖,和開放閱讀框架圖。
通過NCBI網(wǎng)站進行核苷酸和蛋白質(zhì)BLAST搜索。
與ClustalW接口執(zhí)行多個對齊。
反向互補序列和色譜圖。
通過精確匹配或較優(yōu)對齊搜索序列。
編輯核苷酸序列時顯示翻譯。
進行反向翻譯并繪制核苷酸簡并。
繪制蛋白質(zhì)的親水性和抗原性。
復制色譜切片的圖像,粘貼到文檔或演示文稿中。
系統(tǒng)需求
Compatible with Windows 7sp1, 8, 10.
北京天演融智軟件有限公司(科學軟件網(wǎng))是 ChromasPro 軟件在中國的授權(quán)經(jīng)銷商,為中國的 ChromasPro 軟件用戶提供優(yōu)質(zhì)的軟件銷售和培訓服務。
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詞條說明
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